缺血性脑卒中（IS）致病因素多，病机复杂，针对某一分子因素的调节或干预效果不理想。中医学基于整体观认识疾病，但辨证、疗效机制生物学基础不足，而多组学可从不同层面揭示疾病的病因病机，使在分子水平构建机体调控网络成为可能。本文基于中医整体观，结合多组学构建IS的中西医结合防治思路，以期深入揭示IS的病因病机，为其中医辨证、疗效机制提供分子生物学依据，从而提高中西医结合防治IS的临床效果，降低IS发病率与复发率，推动中西医结合医学的创新发展。